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2010/5/15　研究に利用する装置（３）プロテインシークエンサー

すでに、HPLC装置とLC/MS装置を紹介しました。この２つの装置を用いれば、物質の精製とある程度の構造情報（分子量）が得られ、ペプチドならば、構成するアミノ酸のおおよその数が推定できます。しかし、ペプチドのアミノ酸配列を決定するためには、今回紹介する「プロテインシークエンサー」が必要となります。

この装置は、ペプチドの一番端にあるアミノ酸を切断（エドマン分解）して検出するという作業を繰り返し、ペプチドに含まれるアミノ酸を端から順番に決めていきます。なお、アミノ酸を分析するために、ここでもHPLC装置が利用されています。したがって、プロテインシークエンサーは、ペプチドを分解してアミノ酸を調製する装置と、それを分析するHPLC装置により構成されています。

下の写真のプロテインシークエンサーは、2006年に研究室に設置されたものです。それまでは、学部共通機器を利用していましたが、研究室にこの装置が導入されたことにより、ペプチドの構造決定が非常に効率よく行われるようになりました。血圧降下ペプチド（Met-Asn-Pro-Pro-Lysなど）、抗ストレスペプチド（Asp-Leu-Tyr-Alaなど）、ビフィズス菌増殖促進ペプチド（Glu-Leu-Met）といった、多くの新規生理活性ペプチドの構造決定に、この装置は貢献してくれました。

イメージ

右側の部分で調製されたアミノ酸が、HPLCにより分析されます。写真には写っていませんが、左側に連結しているパソコンにより、アミノ酸配列データが得られます。